تنوع آنالوگ ژن‌های مقاومت به بیماری زیرخانواده CC-NBS-LRR در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو
پذیرفته شده برای پوستر
عنوان دوره: سیزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
گروه به‌نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
چکیده
در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در شش رقم زراعی و سه گونه وحشی جو ، از دو ترکیب آغازگر دژنره طراحی شده بر اساس دامنه حفاظت شده non-TIR یا CC ژن های مقاومت به بیماری گیاهی استفاده شد. برای شناسایی RGAها تعدادی از نوارها جداسازی و مورد توالی‌یابی قرار گرفتند. مقایسه توالی‌ها با توالی‌های موجود در داده پایگاه NCBI نشان دهنده شباهت بالای توالی برخی از قطعات تکثیری در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو با ژن‌های مقاومت شناخته شده و RGAها مانند ژن‌های مقاومت Lr1، Lr34، Rpg4 و Rpg5 بود. توالی قطعات متناظر همردیف شده و تنوع نوکلئوتیدی و شباهت بین توالی‌ها محاسبه و گروه‌بندی بین توالی قطعات انجام شد. تعدادی از توالی قطعات تکثیری ارقام زراعی شباهت نسبتاً بالایی با گونه‌های وحشی نشان دادند.
کلیدواژه ها
Title
Nucleotide diversity of resistance gene analogous, sub family of CC-NBS-LRR in barley cultivars and its wild relatives
Authors
Abstract
In this study, for isolation of disease resistance gene analogs in six barley cultivars and three wild species, a combination of two degenerate primers designed based on conserved domain of non-TIR or CC plant disease resistance genes were used. Some of the bands were isolated and sequenced to identify the RGA. Comparing of the sequences with available sequences in NCBI databases showed high similarity between sequences of amplified fragments in the cultivated and wild relatives of barley with known resistance genes and RGA such as resistance genes Lr1, Lr34, Rpg4 and Rpg5. Sequence alignment was done and nucleotide diversity and similarity between sequences were estimated and regimentation between sequences were done. Cultivars and wild species showed high sequence identity in some of the amplified fragments.