بررسی تنوع ژنتیکی و طبقهبندی ارقام برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با مکانهای ژنی کنترلکننده مقدار روی
پذیرفته شده برای پوستر
عنوان دوره: سیزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
1دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران
2دانش آموخته بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران
3استادیار پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج
چکیده
این پژوهش به منظور بررسی تنوع ژنتیکی مجموعهای از 50 رقم برنج با استفاده از 15 نشانگر ریزماهواره پیوسته با مکانهای ژنی1 کنترلکننده مقدار روی دانه انجام گرفت. میزان روی دانه با دستگاه جذب اتمی در دو تکرار اندازهگیری شد و ارقام نعمت و دادرس با مقادیر 94/10 و 92/36 میلیگرم بر کیلوگرم کمترین و بیشترین محتوای روی در دانه را دارا بودند. طبق نتایج تجزیه مولکولی، در مجموع 80 آلل شناسایی گردید که بیشترین تعداد آلل و نیز میزان تنوع ژنی (8/0) در نشانگر RM257 مشاهده شد. گروهبندی فنوتیپی به روش Complete Linkage و مربع فاصله اقلیدوسی و خوشهبندی مولکولی به روش Neighbor Net و ضریب فاصله P Distanceانجام شد. با توجه به مطابقت نتایج خوشهبندی مولکولی با خوشهبندی فنوتیپی روی میتوان بیان کرد که مکانهای ژنی مورد مطالعه، در کنترل روی ارقام ایرانی نیز مؤثر میباشند، همچنین رقم دادرس را میتوان به عنوان رقم مناسب در برنامههای اصلاحی مقدار روی دانه توصیه نمود.
کلیدواژه ها
Title
Study of genetic variation and classification in rice cultivars by using molecular markers linked with QTLs of controlling Zn content
Authors
Abstract
The study was designed to characterize the genetic diversity within a subset of 50 rice varieties using 15 microsatellite markers linked to the QTLs controlling zinc grain content. The grain Zinc content were measured using atomic absorption with two replications and Neemat and Dadras cultivars with the amount of 10.94 and 36.92 mg.Kg-1 had the lowest and highest grain Zinc content, respectively. According to the analysis of molecular, RM257 was showed highest number of allele and gene diversity (0.8). grouping phenotypic was performed by Complete Linkage method and the squared Euclidean distance, molecular clustering was conducted using Neighbor Net method and coefficient of P Distance. Refer to similarity between molecular and phenotypic clustering for zinc, it is concluded that loci studied in this research are effective in controlling zinc in Iranian rice cultivars. Furthermore the Dadras cultivar can be advised as appropriate a cultivar in zinc grain breeding programs.