بررسی تغییرات ترانسکریپتوم برنج در مرحله گیاهچهای در پاسخ به تنش خشکی
پذیرفته شده برای پوستر
اصل مقاله (492.54 K)
عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
1دانشجوی دکتری، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، گروه زراعت و اصلاح نباتات
2اﺳﺘﺎدﻳﺎر، داﻧﺸﮕﺎه ﺷﻴﺮاز، داﻧﺸﻜﺪه ﻛﺸﺎورزی، ﮔﺮوه زراﻋﺖ و اﺻﻼح ﻧﺒﺎﺗﺎت
چکیده
ﺧﺸﻜﻲ ﺑﻪ ﻋﻨﻮان ﻣﻬﻢﺗﺮﻳﻦ و راﻳﺞﺗﺮﻳﻦ ﺗﻨﺶ ﻣﺤﻴﻄﻲ در ﺟﻬﺎن ﺑﻪ ﺷﻤﺎر ﻣﻲرود. اﻳﻦ ﺗﻨﺶ ﻃﻴﻒ وﺳﻴﻌﻲ از ژنﻫﺎ ﻛﻪ در ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ درﮔﻴﺮ ﻫﺴﺘﻨﺪ را اﻟﻘﺎ ﻣﻲﻛﻨﺪ. آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻋﻤﻠﻜﺮدی اﻳﻦ ژنﻫﺎ ﻓﻬﻢ ﻣﺎ را در راﺑﻄﻪ ﺑﺎ ﻣﻜﺎﻧﻴﺴﻢﻫﺎی ﻣﻮﻟﻜﻮﻟﻲ ﻛﻨﺘﺮل ﻛﻨﻨﺪه ﺗﺤﻤﻞ و ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ در ﮔﻴﺎﻫﺎن اﻓﺰاﻳﺶ ﻣﻲدﻫﺪ و در ﻧﻬﺎﻳﺖ ﻣﻲﺗﻮان از آن ﺑﺮای ﺑﻬﺒﻮد ژﻧﺘﻴﻜﻲ ارﻗﺎم ﺣﺴﺎس ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ ﺑﻬﺮه ﺑﺮد. ﺑﻪ ﻫﻤﻴﻦ دﻟﻴﻞ در اﻳﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ ﺗﻐﻴﻴﺮات ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم ﺑﺮﻧﺞ در ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ ﺑﺮرﺳﻲ ﮔﺮدﻳﺪ. اﺑﺘﺪا دادهﻫﺎی ﺧﺎم ﻣﻴﻜﺮواری ﻣﺮﺑﻮط ﺑﻪ ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ و ﺷﺎﻫﺪ از ﭘﺎﻳﮕﺎه داده GEO ﮔﺮﻓﺘﻪ ﺷﺪﻧﺪ. در اﻳﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ ﺑﺮای ﺗﻌﻴﻴﻦ ﺗﻐﻴﻴﺮات ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم ﺑﺮﻧﺞ، ﺑﻌﺪ از رﺷﺪ ﮔﻴﺎﻫﭽﻪﻫﺎ در ﻣﺤﻴﻂ ﻫﻴﺪروﭘﻮﻧﻴﻚ و ﺗﻴﻤﺎر ﺑﺎ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ )ﺑﺎ ﻧﮕﻪ داﺷﺘﻦ ﮔﻴﺎﻫﭽﻪﻫﺎ ﺑﻪ ﻣﺪت 24 ﺳﺎﻋﺖ در ﺧﺎرج از ﻣﺤﻴﻂ ﻛﺸﺖ(، RNA ﻛﻞ از ﺑﺎﻓﺖ ﺑﺮگ ﺗﺤﺖ ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ و ﺷﺎﻫﺪ در دو ﺗﻜﺮار اﺳﺘﺨﺮاج ﺷﺪه اﺳﺖ. ﭘﺲ از ﻧﺮﻣﺎل ﺳﺎزی دادهﻫﺎ، ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﺗﻌﻴﻴﻦ ﺗﻔﺎوتﻫﺎی ﻣﻌﻨﻲدار ﺑﻴﻦ ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ و ﺷﺎﻫﺪ، از آزﻣﻮن t-test اﺳﺘﻔﺎده ﺷﺪ و در ﻧﻬﺎﻳﺖ ﺷﺒﻜﻪ ژﻧﻲ رﺳﻢ ﮔﺮدﻳﺪ. ﺑﺮ اﺳﺎس ﻧﺘﺎﻳﺞ، از ﺑﻴﻦ 1354896 ژن، ﺑﻪ ﺗﺮﺗﻴﺐ 778 و 693 ژن در ﺳﻄﺢ اﺣﺘﻤﺎل 5 درﺻﺪ، ﺣﺪاﻗﻞ ﻫﻔﺖ ﺑﺮاﺑﺮ ﻛﺎﻫﺶ و اﻓﺰاﻳﺶ ﺑﻴﺎن ﻧﺴﺒﺖ ﺑﻪ ﺷﺎﻫﺪ داﺷﺘﻨﺪ. آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻋﻤﻠﻜﺮدی ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ﺑﻴﺶ از 16 درﺻﺪ از اﻳﻦ ژنﻫﺎ در ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ و ﺑﻘﻴﻪ ژنﻫﺎ در ﺗﻮﻟﻴﺪ ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦﻫﺎی ﻋﻤﻠﻜﺮدی از ﻗﺒﻴﻞ ﭼﺎﭘﺮونﻫﺎ، ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦﻫﺎی وﻓﻮر ﺟﻨﻴﻦزاﻳﻲ ﺗﺎﺧﻴﺮی و دﻫﻴﺪرﻳﻦﻫﺎ درﮔﻴﺮ ﻫﺴﺘﻨﺪ.
کلیدواژه ها