اﺳﺘﻔﺎده از آﻧﺎﻟﻴﺰ ﺑﻴﻮاﻧﻔﻮرﻣﺎﺗﻴﻜﻲ ﺑﻪﻣﻨﻈﻮر ﺑﺮرﺳﻲ ﻧﻘﺶ ژنﻫﺎی ﻫﺪفmiRNAﻫﺎی ﮔﻮﺟﻪﻓﺮﻧﮕﻲ
پذیرفته شده برای پوستر
عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
1هیات علمی گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
2دانشجوی کارشناسی ارشد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
3هیات علمی گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه ملایر، ملایر، ایران
چکیده
miRNAﻫﺎ مولکولهای RNAﻫﺎی ﻛﻮﭼﻚ ﺗﻨﻈﻴﻢﻛﻨﻨﺪهای ﻫﺴﺘﻨﺪ ﻛﻪ در ﻓﺮآﻳﻨﺪﻫﺎی ﻣﺨﺘﻠﻒ ﺑﻴﻮﻟﻮژﻳﻜﻲ ﮔﻴﺎه ﻧﻘﺶ دارﻧﺪ. اﻳﻦ ﻣﻮﻟﻜﻮلﻫﺎ ﺑﻪ ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ ﺗﺮﺟﻤﻪ ﻧﺸﺪه وﻟﻲ در ﻛﻨﺘﺮل ﺑﺴﻴﺎری از ژنﻫﺎی ﻛﺪﻛﻨﻨﺪه ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ ﻧﻘﺶ دارﻧﺪ. در اﻳﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ، miRNAﻫﺎی ﺑﺎﻟﻎ و ﭘﻴﺸﺴﺎز ﮔﻮﺟﻪﻓﺮﻧﮕﻲ و ژنﻫﺎی ﻫﺪف آنﻫﺎ ﻣﻮرد ﺑﺮرﺳﻲ ﻗﺮارﮔﺮﻓﺘﻪاﻧﺪ. ﺗﺎﻛﻨﻮن در اﻳﻦ ﮔﻴﺎه 77 ﭘﻴﺸﺴﺎز ﻣﻌﺮﻓﻲﺷﺪهاﻧﺪ ﻛﻪ درﻣﺠﻤﻮع 110 miRNA ﺑﺎﻟﻎ ﺗﻮﻟﻴﺪ ﻣﻲﻛﻨﻨﺪ. ﻧﺘﺎﻳﺞ ﺑﺮرﺳﻲ ﺗﻮزﻳﻊ ﻃﻮل ﺑﺮای ﺳﺎﺧﺘﺎرﻫﺎی ﺳﺎﻗﻪ-ﺣﻠﻘﻪ در ﮔﻮﺟﻪﻓﺮﻧﮕﻲ ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ 50 درﺻﺪ ﺳﺎﺧﺘﺎرﻫﺎی ﺳﺎﻗﻪ ﺣﻠﻘﻪ در اﻳﻦ ﮔﻴﺎه ﺑﻴﻦ 80 ﺗﺎ 180 ﻧﻮﻛﻠﺌﻮﺗﻴﺪ ﻃﻮل دارﻧﺪ. درﻣﺠﻤﻮع ﺑﺮای ﻫﻤﻪ miRNAﻫﺎ 322 ژن ﻫﺪف ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪ ﻛﻪ ﺷﺎﻣﻞ 237 ژن ﻣﻨﺤﺼﺮﺑﻪﻓﺮد ﺑﻮد. ﺑﺮﺧﻲ ژنﻫﺎ ﺗﻮﺳﻂ ﭼﻨﺪﻳﻦ miRNAﻫﺎ ﺑﻪﻋﻨﻮان ﻫﺪف ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﻣﻲ ﺷﻮﻧﺪ. ﻋﻤﺪه ژنﻫﺎی ﻫﺪف از ﻃﺮﻳﻖ ﻣﻜﺎﻧﻴﺴﻢ ﺑﺮش ﺗﻮﺳﻂ miRNAﻫﺎ ﻛﻨﺘﺮل ﻣﻲﺷﻮﻧﺪ. آﻧﺎﻟﻴﺰ GSEA ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ژنﻫﺎی ﻫﺪف miRNAﻫﺎ در ﺑﺴﻴﺎری از ﻓﺮاﻳﻨﺪﻫﺎی ﺣﻴﺎﺗﻲ ﮔﻴﺎه ﻧﻘﺶ داﺷﺘﻪ و ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ اﺳﺘﺮس، اﺗﺼﺎل ﺑﻪ DNA، ﻓﻌﺎﻟﻴﺖ ﻓﺎﻛﺘﻮرﻫﺎی روﻧﻮﻳﺴﻲ،اﻧﺘﻘﺎل ﺳﻴﮕﻨﺎل، اﺗﺼﺎل ﺑﻪ ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ و ﻓﻌﺎﻟﻴﺖ ﻛﻴﻨﺎزﻫﺎ ﻣﻬﻢﺗﺮﻳﻦ ﻓﻌﺎﻟﻴﺖﻫﺎی ﺗﺤﺖ ﻛﻨﺘﺮل miRNAﻫﺎ ﻫﺴﺘﻨﺪ.
کلیدواژه ها