واﻛﺎوی ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم ﮔﻴﺎه ﺟﻮ (Hordeum vulgare) ﺑﺮ اﺳﺎس ﺗﻜﻨﻴﻚ RNA-Seq ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﻣﻄﺎﻟﻌﻪی ﻛﺎرﻛﺮد ژﻧﻮم و ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ژنﻫﺎی ﻛﻠﻴﺪی در ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺷﻮری

پذیرفته شده برای پوستر اصل مقاله (425.24 K)

عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران

روح الله شاملو دشت پا گردی

ﻫﻴﺎت ﻋﻠﻤﻲ ﮔﺮوه ﻛﺸﺎورزی و ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻃﺒﻴﻌﻲ ﻣﺮﻛﺰ آﻣﻮزش ﻋﺎﻟﻲ اﻗﻠﻴﺪ

ﺗﻜﻨﻴﻚ RNA sequencing (RNA-Seq) روﺷﻲ ﻧﻮﻳﻦ اﺳﺖ ﻛﻪ اﻣﻜﺎن ﻣﻄﺎﻟﻌﻪی دﻗﻴﻖ ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر روﺷﻦ ﺷﺪن ﻧﺤﻮه ﻓﻌﺎﻟﻴﺖ ﺑﺨﺶﻫﺎی ﻛﺪ ﻛﻨﻨﺪه و ﻏﻴﺮ ﻛﺪ ﻛﻨﻨﺪه ژﻧﻮم را در ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺷﺮاﻳﻂ داﺧﻠﻲ و ﺑﻴﺮوﻧﻲ ﮔﻴﺎه از ﺟﻤﻠﻪ ﺗﻨﺶﻫﺎی ﻏﻴﺮزﻳﺴﺘﻲ ﻓﺮآﻫﻢ ﻧﻤﻮده اﺳﺖ. درک ﭼﮕﻮﻧﮕﻲ ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ در ﮔﻴﺎﻫﺎن ﻛﻪ از ﭼﻨﻴﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﺎﺗﻲ ﺣﺎﺻﻞ ﻣﻲﺷﻮد، ﺑﺮای اﻳﺠﺎد ﮔﻴﺎﻫﺎن ﻣﺘﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ و دارای ﭘﺎﻳﺪاری ﻋﻤﻠﻜﺮد ﺟﻬﺖ ﺣﻔﻆ اﻣﻨﻴﺖ ﻏﺬاﻳﻲ ﺑﺸﺮ ﺿﺮوری ﻣﻲﺑﺎﺷﺪ. در اﻳﻦ ﭘﮋوﻫﺶ، ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ ﭘﺎﺳﺦ ﮔﻴﺎه ﺟﻮ، ﺑﻪ ﻋﻨﻮان ﭼﻬﺎرﻣﻴﻦ ﮔﻴﺎه زراﻋﻲ ﻣﻬﻢ در ﺟﻬﺎن، ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺷﻮری در ﺳﻄﺢ ژﻧﻮم و ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ و ﻣﻌﺮﻓﻲ ژن ﻫﺎی ﻣﻬﻢ در ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ، ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از اﺑﺰارﻫﺎ و روشﻫﺎی ﺑﻴﻮاﻧﻔﻮرﻣﺎﺗﻴﻚ و آﻣﺎری، دادهﻫﺎی ﻳﻚ آزﻣﺎﻳﺶ RNA-Seq در ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ ﺷﻮری واﻛﺎی ﮔﺮدﻳﺪ. ﻧﺘﺎﻳﺞ ﺑﻪ روﺷﻨﻲ ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ﻓﻌﺎﻟﻴﺖ ژﻧﻮم ﮔﻴﺎه در ﺷﺮاﻳﻂ ﺗﻨﺶ ﺷﻮری ﺑﻪ ﺳﻤﺖ ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺗﻨﺶﻫﺎ ﺟﻬﺖﮔﻴﺮی ﻣﻌﻨﻲداری دارد. از 5692 ژن ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪه ﻛﻪ دارای ﺑﻴﺎن اﻓﺘﺮاﻗﻲ ﺑﻮدﻧﺪ، 2665 و 3027 ژن ﺑﻪ ﺗﺮﺗﻴﺐ اﻓﺰاﻳﺶ و ﻛﺎﻫﺶ ﺑﻴﺎن داﺷﺘﻨﺪ. ﺑﺮرﺳﻲ ﺷﺒﻜﻪ ژﻧﻲ ﺑﻴﻦ اﻳﻦ ژنﻫﺎ ﻣﺸﺨﺺ ﻧﻤﻮد ﻛﻪ 6 ژن HB-12 ،F12E4 (Dbp) ،LOS2،MEKK1 ،AAO3 و MDH، ﻛﻪ ﻫﺮ ﻛﺪام در ﻓﺮآﻳﻨﺪﻫﺎی ﮔﺴﺘﺮدهای ﻧﻘﺶ دارﻧﺪ، ﻧﺴﺒﺖ ﺑﻪ دﻳﮕﺮ ژنﻫﺎ دارای اﻫﻤﻴت ﺑﻴﺸﺘﺮی ﻫﺴﺘﻨﺪ و ﻣﻲﺗﻮاﻧﻨﺪ در دﺳﺖورزی ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺑﻪ ﻛﺎر ﮔﺮﻓﺘﻪ ﺷﻮﻧﺪ.

ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم؛ ﺗﻨﺶ ﺷﻮری؛ ﺷﺒﻜﻪ ژﻧﻲ