شناسایی عوامل رونویسی شایع در ژنهای پاسخ دهنده به تنش خشکی در گیاه جو براساس ابزار تحت وب Genevestigator

پذیرفته شده برای پوستر XML اصل مقاله (263.57 K)
عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
1گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران
2بخش زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
3بخش تحقیقات فیزیولوژی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران Ghazalehjavadi
چکیده
تنش ﺧﺸﻜﻲ ﻳﻜﻲ از ﻣﻬﻢﺗﺮﻳﻦ ﻋﻮاﻣﻞ ﻛﺎﻫﺶ ﺑﻬﺮه وری ﺗﻮﻟﻴﺪ ﻣﺤﺼﻮﻻت ﻛﺸﺎورزی در ﺳﺮاﺳﺮ ﺟﻬﺎن و ﻫﻤﭽﻨﻴﻦ اﻳﺮان ﺑﻪ ﺷﻤﺎر ﻣﻲرود. ﮔﻴﺎه ﺟﻮ ﻳﻜﻲ از ﭼﻬﺎر ﻏﻠﻪ ﻣﻬﻢ دﻧﻴﺎﺳﺖ ﻛﻪ دارای ﺗﺤﻤﻞ ﻧﺴﺒﻲ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ اﺳﺖ. ﭘﮋوﻫﺶ ﺑﺮ روی ﺳﺎزوﻛﺎرﻫﺎی ﺗﺤﻤﻞ ﺗﻨﺶ در ﮔﻴﺎه ﺟﻮ ﻣﻲﺗﻮاﻧﺪ در درک ﺑﻬﺘﺮ اﺳﺎس ژﻧﺘﻴﻜﻲ ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ ﻣﻔﻴﺪ واﻗﻊ ﺷﻮد و در ﻧﻬﺎﻳﺖ ﺑﻪ ﺑﻬﺒﻮد ﺧﺼﻮﺻﻴﺎت ژﻧﺘﻴﻜﻲ دﺧﻴﻞ در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ از ﻃﺮﻳﻖ روشﻫﺎی ﻧﻮﻳﻦ ژﻧﺘﻴﻚ ﻣﻮﻟﻜﻮﻟﻲ ﻛﻤﻚ ﻛﻨﺪ. ﺗﻤﺎﻣﻲ ژنﻫﺎی دارای ﺑﻴﺎن اﻓﺘﺮاﻗﻲ (2/5 و 2/5- )در ﺑﻴﻦ ﺗﻤﺎﻣﻲ آزﻣﺎﻳﺸﺎت رﻳﺰآراﻳﻪ اﻧﺠﺎم ﺷﺪ، ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از ﻧﺮماﻓﺰار Genevestigator ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪﻧﺪ و آﻧﺎﻟﻴﺰ ﭘﺮوﻣﻮﺗﻮر ژنﻫﺎی ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪه ﺗﻮﺳﻂ ﺑﺴﺘﻪ ﻧﺮم اﻓﺰاری Genomatix و ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از ﻧﺮم اﻓﺰار Gene2Promoterاﺳﺘﺨﺮاج ﮔﺮدﻳﺪ. ﻧﺘﺎﻳﺞ آﻧﺎﻟﻴﺰ ﭘﺮوﻣﻮﺗﺮ ژنﻫﺎی ﻫﺎب دﺧﻴﻞ در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ در اﻧﺪامﻫﺎی روﻳﺸﻲ و زاﻳﺸﻲ ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ﺷﺎﻳﻊﺗﺮﻳﻦ ﺟﺎﻳﮕﺎه ﻋﻮاﻣﻞ روﻧﻮﻳﺴﻲ ﺑﻪ ﺗﺮﺗﻴﺐ CCT ،TCP ،BCP ،Bzip ،Zinc finger ،LIC ،bHLH ،NAC ،MYB و ﺎ85ﻫﺴﺘﻨﺪ PHD ﻫﺴﺘﻨﺪ ﻗﺎﺑﻠﻴﺖ اﺗﺼﺎل ﺑﻪ 85 درﺻﺪ از ﭘﺮوﻣﻮﺗﺮﻫﺎ با P-Value ﺑPدﻣﻴﻦ ،TALE، BZR، WRKY، AP2 ، Heterotrimericاﺗﺼﺎل ﻛﻮﭼﻚﺗﺮ از 0/05 را دارﻧﺪ. ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ اﻳﻦ ﻋﻮاﻣﻞ روﻧﻮﻳﺴﻲ و ژنﻫﺎﻳﻲ ﻛﻪ در ﭘﺮوﻣﻮﺗﺮ ﺧﻮد دارای ﺟﺎﻳﮕﺎه اﺗﺼﺎل ﺑﺮای اﻳﻦ ﻋﻮاﻣﻞ روﻧﻮﻳﺴﻲ ﻫﺴﺘﻨﺪ، ﻣﻲﺗﻮاﻧﺪ ﺑﻪ ﺷﻨﺎﺧﺖ ﻫﺮ ﭼﻪ ﺑﻴﺸﺘﺮ ﺳﺎزوﻛﺎر ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺗﻨﺶ ﺧﺸﻜﻲ در ﮔﻴﺎه ﺟﻮ ﻛﻤﻚ ﻛﻨﺪ
کلیدواژه ها