مقایسه ی روش فنل-کلروفرم معمول با روش تغییر یافته برای استخراج RNA از گیاه بومادران (Achillea millefolium)

پذیرفته شده برای پوستر
عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
1دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و بهنژادی گیاهی دانشگاه شهید چمران اهواز
2دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز
3استادیار دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز
چکیده
ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﺖﻫﺎی ﺛﺎﻧﻮﻳﻪ، ﻣﺎﻧﻨﺪ ﺗﺮﻛﻴﺒﺎت ﻓﻨﻠﻲ و ﭘﻠﻲﺳﺎﻛﺎرﻳﺪﻫﺎ اﺳﺘﺨﺮاج RNA را دﭼﺎر ﻣﺸﻜﻞ ﻛﻨﻨﺪ. اﻳﻦ ﺗﺮﻛﻴﺒﺎت ﺑﻪ RNA ﻣﺘﺼﻞ ﺷﺪه و ﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ رﺳﻮب RNA ﻣﻲﺷﻮﻧﺪ. ﭘﻴﺎﻣﺪ اﻳﻦ رﺧﺪاد ﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ ﻛﺎﻫﺶ ﺷﺪﻳﺪ RNA ﺳﺎﻟﻢ در ﻣﺤﺼﻮل ﻧﻬﺎﻳﻲ ﻣﻲﺷﻮد. ﮔﺮﭼﻪ در ﮔﺰارﺷﺎت ﻋﻠﻤﻲ، ذﻛﺮ ﺷﺪه اﺳﺖ ﻛﻪ روش ﻓﻨﻞ- ﻛﻠﺮوﻓﺮم ﻣﻨﺎﺳﺐ اﺳﺘﺨﺮاج RNA از ﮔﻴﺎﻫﺎﻧﻲ ﻛﻪ ﺣﺎوی ﻣﻴﺰان ﺑﺎﻻی ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﺖ ﺛﺎﻧﻮﻳﻪ ﻣﻲﺑﺎﺷﻨﺪ وﻟﻲ ﻣﺎ ﺑﺮای ﺑﺪﺳﺖ آوردن RNA ﺑﺎ ﻛﻴﻔﻴﺖ ﺑﺎﻻ ﺑﺎ ﻣﺸﻜﻼﺗﻲ روﺑﺮو ﺷﺪﻳﻢ. ﺑﻨﺎﺑﺮاﻳﻦ ﺑﺮای ﺑﺪﺳﺖ آوردن RNA ﺑﺎ ﻛﻴﻔﻴﺖ ﺑﺎﻻ، ﺗﻐﻴﻴﺮاﺗﻲ در روش ﺳﻨﺘﻲ ﻓﻨﻞ-ﻛﻠﺮوﻓﺮم اﻋﻤﺎل ﮔﺮدﻳﺪ. در ﻣﻘﺎﻳﺴﻪ ﺑﺎ روش ﻗﺒﻠﻲ، روش ﭘﻴﺸﻨﻬﺎدی ﻣﺎ را ﻗﺎدر ﻣﻲﺳﺎزد ﻛﻪ در ﻃﻮل زﻣﺎن ﻛﻤﺘﺮی ﺑﻪ RNA ﺑﺎ ﻛﻤﻴﺖ و ﻛﻴﻔﻴﺖ ﺑﺎﻻ دﺳﺖ ﻳﺎﺑﻴﻢ. ﺑﺮرﺳﻲ ﺗﺼﻮﻳﺮ ﺣﺎﺻﻞ از ژل اﻟﻜﺘﺮوﻓﻮرز ﺑﻴﺎﻧﮕﺮ ﺑﺮﺗﺮی ﻛﻴﻔﻴﺖ RNA ﺑﺪﺳﺖ آﻣﺪه از روش ﭘﻴﺸﻨﻬﺎدی ﻣﻲﺑﺎﺷﺪ. ﻧﻮﻳﺴﻨﺪﮔﺎن ﻣﻌﺘﻘﺪﻧﺪ ﻛﻪ ﻛﺎرﺑﺮد روش ﭘﻴﺸﻨﻬﺎدی ﺑﺮای اﺳﺘﺨﺮاج RNA از ﮔﻴﺎه ﺑﻮﻣﺎدران ﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ ﻛﺴﺐ RNA ﺑﺎ ﻛﻤﻴﺖ و ﻛﻴﻔﻴﺖ ﺑﺎﻻ ﻣﻲﺷﻮد. ﭼﻨﻴﻦ RNA ﺑﻲﻧﻘﺼﻲ ﻻزﻣﻪ ﻣﻄﺎﻟﻌﺎت ﺗﺮاﻧﺴﻜﺮﻳﭙﺘﻮم از ﻗﺒﻴﻞ ﻧﺴﻞ ﺟﺪﻳﺪ ﺗﻮاﻟﻲﻳﺎﺑﻲ، ﺳﺎﺧﺖ ﻛﺘﺎﺑﺨﺎﻧﻪ cDNA، ﻣﻴﻜﺮوآراﻳﻪ، RT-PCR و Real-Time PCR، ﻣﻲﺑﺎﺷﺪ.
کلیدواژه ها