مطالعه بیوانفورماتیکی نقش ژن رمز کننده بتا- آمیلاز ( 1BAMY ) در تحمل به خشکی در برنج
پذیرفته شده برای پوستر
اصل مقاله (372.88 K)
عنوان دوره: پانزدهمین کنگره زراعت و اصلاح نباتات ایران
نویسندگان
استادیار گروه اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی داراب
چکیده
ﺑﺮﻧﺞ ﺑﻪ ﻋﻨﻮان ﻳﻜﻲ از اﺻﻠﻲ ﺗﺮﻳﻦ ﻣﻮاد ﻏﺬاﻳﻲ از ﺟﺎﻳﮕﺎه وﻳﮋه ای ﺑﺮﺧﻮردار ﻣﻲ ﺑﺎﺷﺪ. از ﻃﺮﻓﻲ ﺧﺸﻜﺴﺎﻟﻲ ﻳﻜﻲ از ﻋﻮاﻣﻞ اﺻﻠﻲ ﻣﺤﺪود ﻛﻨﻨﺪه ﻋﻤﻠﻜﺮد ﺑﺮﻧﺞ ﻣﻲ ﺑﺎﺷﺪ. در ﺳﺎل ﻫﺎی اﺧﻴﺮ ﺗﻮﺟﻪ ﻛﺎﻓﻲ ﺑﻪ درک اﺳﺎس ژﻧﺘﻴﻜﻲ ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ اﺧﺘﺼﺎص داده ﺷﺪه ﻛﻪ ﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ ﻛﺸﻒ ژن ﻫﺎی ﭘﺎﺳﺦ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ ﺟﺪﻳﺪی از ﺟﻤﻠﻪ ژن رﻣﺰ ﻛﻨﻨﺪه ﺑﺘﺎ آﻣﻴﻼز (LOC_Os10g32810)
(BAMY1) ﺷﺪه اﺳﺖ. در اﻳﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﺑﺮرﺳﻲ ﺑﻴﺸﺘﺮ ﻧﻘﺶ ژن BAMY1 در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ از ﺳﺎﺧﺖ ﺷﺒﻜﻪ ﺑﺮﻫﻤﻜﻨﺶ ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ-ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ و آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻏﻨﻲ ﺳﺎزی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی و ﻣﺴﻴﺮ KEGG اﺳﺘﻔﺎده ﺷﺪ. آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻏﻨﻲ ﺳﺎزی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺑﺮ ﻣﺒﻨﺎی ﻓﺮاﻳﻨﺪ ﺑﻴﻮﻟﻮژﻳﻜﻲ و ﻛﺎرﻛﺮد ﻣﻮﻟﻜﻮﻟﻲ ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ﺑﻪ ﺗﺮﺗﻴﺐ ﺷﺶ و ﭘﻨﺞ ﮔﺮوه ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺑﻪ ﻃﻮر ﻣﻌﻨﻲ داری ﻏﻨﻲ ﺷﺪه اﻧﺪ. ﻫﻤﭽﻨﻴﻦ آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻣﺴﻴﺮ KEGGﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ دو ﻣﺴﻴﺮ ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﺴﻢ ﺳﺎﻛﺎرز و ﻧﺸﺎﺳﺘﻪ و ﻣﺴﻴﺮﻫﺎی ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﻜﻲ 01100 ﮔﺮدﻳﺪ. در ﻣﺠﻤﻮع، ﺑﺎ ﺗﻮﺟﻪ ﺑﻪ ﻧﻘﺶ ﮔﺮوه ﻫﺎی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪه در ﺷﺒﻜﻪ، در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ، ﭼﻨﻴﻦ ﻧﺘﻴﺠﻪ ﮔﻴﺮی ﻣﻲ ﺷﻮد ﻛﻪ ژن BAMY1 ﻣﻲ ﺗﻮاﻧﺪ ﺑﻪ ﻋﻨﻮان ﻛﺎﻧﺪﻳﺪ ﻣﻨﺎﺳﺒﻲ ﺟﻬﺖ دﺳﺘﻮرزی ژﻧﺘﻴﻜﻲ ﺑﺎ ﻫﺪف ﺑﻬﺒﻮد ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ در ﺑﺮﻧﺞ ﻣﻮرد اﺳﺘﻔﺎده ﻗﺮار ﮔﻴﺮد.
(BAMY1) ﺷﺪه اﺳﺖ. در اﻳﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌﻪ ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﺑﺮرﺳﻲ ﺑﻴﺸﺘﺮ ﻧﻘﺶ ژن BAMY1 در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ از ﺳﺎﺧﺖ ﺷﺒﻜﻪ ﺑﺮﻫﻤﻜﻨﺶ ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ-ﭘﺮوﺗﺌﻴﻦ و آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻏﻨﻲ ﺳﺎزی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی و ﻣﺴﻴﺮ KEGG اﺳﺘﻔﺎده ﺷﺪ. آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻏﻨﻲ ﺳﺎزی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺑﺮ ﻣﺒﻨﺎی ﻓﺮاﻳﻨﺪ ﺑﻴﻮﻟﻮژﻳﻜﻲ و ﻛﺎرﻛﺮد ﻣﻮﻟﻜﻮﻟﻲ ﻧﺸﺎن داد ﻛﻪ ﺑﻪ ﺗﺮﺗﻴﺐ ﺷﺶ و ﭘﻨﺞ ﮔﺮوه ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺑﻪ ﻃﻮر ﻣﻌﻨﻲ داری ﻏﻨﻲ ﺷﺪه اﻧﺪ. ﻫﻤﭽﻨﻴﻦ آﻧﺎﻟﻴﺰ ﻣﺴﻴﺮ KEGGﻣﻨﺠﺮ ﺑﻪ ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ دو ﻣﺴﻴﺮ ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﺴﻢ ﺳﺎﻛﺎرز و ﻧﺸﺎﺳﺘﻪ و ﻣﺴﻴﺮﻫﺎی ﻣﺘﺎﺑﻮﻟﻴﻜﻲ 01100 ﮔﺮدﻳﺪ. در ﻣﺠﻤﻮع، ﺑﺎ ﺗﻮﺟﻪ ﺑﻪ ﻧﻘﺶ ﮔﺮوه ﻫﺎی ژن آﻧﺘﺎﻟﻮژی ﺷﻨﺎﺳﺎﻳﻲ ﺷﺪه در ﺷﺒﻜﻪ، در ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ، ﭼﻨﻴﻦ ﻧﺘﻴﺠﻪ ﮔﻴﺮی ﻣﻲ ﺷﻮد ﻛﻪ ژن BAMY1 ﻣﻲ ﺗﻮاﻧﺪ ﺑﻪ ﻋﻨﻮان ﻛﺎﻧﺪﻳﺪ ﻣﻨﺎﺳﺒﻲ ﺟﻬﺖ دﺳﺘﻮرزی ژﻧﺘﻴﻜﻲ ﺑﺎ ﻫﺪف ﺑﻬﺒﻮد ﺗﺤﻤﻞ ﺑﻪ ﺧﺸﻜﻲ در ﺑﺮﻧﺞ ﻣﻮرد اﺳﺘﻔﺎده ﻗﺮار ﮔﻴﺮد.
کلیدواژه ها